Vi har bara börjat förstå de funktionella nätverken hos de proteiner som kodas av det mänskliga genomet, vars DNA-sekvens nu har kartlagts. Möjligheten att förutsäga geners och proteiners funktion utifrån deras sekvens och sammanhang i biologiska nätverk är nära kopplad till detta mål.
I vissa fall kan proteiners funktion förutsägas utifrån deras struktur eller likheter med andra proteiner med liknande sekvenser. Ofta ger detta dock inte tillräckligt precisa förutsägelser. För att kunna avgöra geners eller proteiners funktion används därför många olika bioinformatiska metoder.
Vid universitetet använder forskare beräkningsbaserade metoder, såsom dolda Markovmodeller, evolutionära modeller och statistiska analysmetoder, för att förutsäga funktioner hos proteiner, biokemiska aktiviteter och biologiska processer.