Forskningsprojekt Mikrobiell metanomsättning i kustvatten och -sediment
Molecular SeaLab är ett samarbete mellan Stockholms universitets Östersjöcentrum och Miljögenomikgruppen vid SciLifeLab. Syftet är att förstå grundläggande mikrobiella processer i kustens ekosystem, genom att kombinera expertis inom ekologi, biogeokemi, bioinformatik och meta-omik.
Mikrobiell metanproduktion och förbrukning styr tillsammans hur mycket metan som slutligen når atmosfären. I Östersjöns kustvatten förändras denna balans rumsligt och tidsmässigt på grund av lokal heterogenitet, skiktade vattenmassor och säsongsbunden syrebrist, vilket tillsammans skapar dynamiska redoxgradienter och förändrar zonerna för både aerob metanoxidation och anaerob metanoxidation (AOM). Vi använder genomupplöst meta-omik, i kombination med aktivitetsmätningar över rumsliga och tidsmässiga gradienter, för att koppla samman mikroorganismernas identitet och funktion med metandynamiken i havsvatten och sediment. De centrala frågorna vi undersöker är hur mikroorganismer som deltar i metankretsloppet är fördelade över miljögradienterna, hur de reglerar sin ämnesomsättning och användning av elektrondonatorer, samt hur de interagerar med syntrofiska partners för att forma metanflödet i kustmiljön.